В Верховном суде адвокаты Алексаняна обжаловали решение Мосгорсуда о продлении ареста своему подзащитному до 2 марта 2008 года. Они требовали освободить Алексаняна по причине прогрессирующей у него неизлечимой болезни. Защитники потребовали от российских властей выполнить наконец указание Европейского суда правам человека о скорейшей госпитализации Алексаняна в специализированную гражданскую клинику по лечению СПИДа.
"Еще до суда его обрекли на смертную казнь, это безумная жестокость", - сказал Пономарев. Он пообещал, что правозащитники продолжат борьбу и уже готово обращение к Уполномоченному по правам человека Владимиру Лукину.
Адвокат Елена Львова ранее заявляля, что тяжелобольному Алексаняну, вопреки решению Европейского суда, в СИЗО не оказывается медицинская помощь. Его состояние с каждым днем ухудшается, прогрессирует слепота. В октябре 2006 года врачи сделали заключение, что Алексанян нуждается в стационарном лечении. Однако вместо специализированной клиники заключенный был помещен в инфекционный отдел "Матросской тишины". Там он заразился туберкулезом.
Диагноз ВИЧ врачи поставили Алексаняну еще в сентябре 2006 года. Тогда врачи решили, что он может оставаться под стражей при условии, если будет получать необходимое лечение. Однако на протяжении почти года Алексаняну не оказывалась никакая медицинская помощь. Сейчас болезнь перешла на более тяжелую стадию: появилась опухоль печени, заболевание лимфатических узлов.
Василий Алексанян был задержан 6 апреля 2006 года по подозрению в хищении и отмывании денег, санкция на его арест была выдана Басманным судом Москвы на следующий день. Басманный суд Москвы 4 декабря 2006 года по ходатайству Генпрокуратуры продлил срок ареста до 2 марта. Вице-президенту "ЮКОСа" предъявили обвинения в хищении акций и имущества "Томскнефти" (на сумму 8 миллиардов рублей) и "Восточной нефтяной компании", а также в неуплате налогов на сумму более трех миллионов рублей (за 2000-2002 годы).